Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Senp6Q6P7W0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.56■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Senp6Q6P7W0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Senp6Q6P7W0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Senp6Q6P7W0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Senp6Q6P7W0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Senp6Q6P7W0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms