Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paxip1Q6NZQ4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paxip1Q6NZQ4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paxip1Q6NZQ4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paxip1Q6NZQ4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Paxip1Q6NZQ4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paxip1Q6NZQ4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paxip1Q6NZQ4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Paxip1Q6NZQ4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Paxip1Q6NZQ4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paxip1Q6NZQ4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Paxip1Q6NZQ4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Paxip1Q6NZQ4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms