Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Soga3Q6NZL0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Soga3Q6NZL0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Soga3Q6NZL0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga3Q6NZL0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Soga3Q6NZL0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga3Q6NZL0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga3Q6NZL0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga3Q6NZL0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Soga3Q6NZL0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Soga3Q6NZL0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Soga3Q6NZL0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Soga3Q6NZL0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Soga3Q6NZL0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Soga3Q6NZL0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.7 ms