Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KdsrQ6GV12 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KdsrQ6GV12 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KdsrQ6GV12 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KdsrQ6GV12 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms