Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbf1Q6DFZ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbf1Q6DFZ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbf1Q6DFZ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbf1Q6DFZ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbf1Q6DFZ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbf1Q6DFZ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gbf1Q6DFZ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbf1Q6DFZ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbf1Q6DFZ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbf1Q6DFZ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms