Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rftn1Q6A0D4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rftn1Q6A0D4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rftn1Q6A0D4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rftn1Q6A0D4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms