Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PatjQ63ZW7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PatjQ63ZW7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PatjQ63ZW7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PatjQ63ZW7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PatjQ63ZW7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PatjQ63ZW7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PatjQ63ZW7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PatjQ63ZW7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PatjQ63ZW7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PatjQ63ZW7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PatjQ63ZW7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PatjQ63ZW7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PatjQ63ZW7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PatjQ63ZW7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PatjQ63ZW7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PatjQ63ZW7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PatjQ63ZW7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PatjQ63ZW7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms