Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col4a5Q63ZW6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col4a5Q63ZW6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Col4a5Q63ZW6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Col4a5Q63ZW6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col4a5Q63ZW6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col4a5Q63ZW6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms