Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1eQ61290 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1eQ61290 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1eQ61290 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1eQ61290 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms