Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rasa3Q60790 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rasa3Q60790 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rasa3Q60790 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rasa3Q60790 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rasa3Q60790 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rasa3Q60790 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms