Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms