Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SynrgQ5SV85 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SynrgQ5SV85 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SynrgQ5SV85 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SynrgQ5SV85 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SynrgQ5SV85 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms