Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PfasQ5SUR0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PfasQ5SUR0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PfasQ5SUR0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PfasQ5SUR0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PfasQ5SUR0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PfasQ5SUR0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PfasQ5SUR0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms