Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms