Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Trim41Q5NCC3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Trim41Q5NCC3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Trim41Q5NCC3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Trim41Q5NCC3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Trim41Q5NCC3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Trim41Q5NCC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Trim41Q5NCC3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Trim41Q5NCC3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Trim41Q5NCC3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Trim41Q5NCC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Trim41Q5NCC3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Trim41Q5NCC3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Trim41Q5NCC3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Trim41Q5NCC3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Trim41Q5NCC3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Trim41Q5NCC3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Trim41Q5NCC3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Trim41Q5NCC3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Trim41Q5NCC3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Trim41Q5NCC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Trim41Q5NCC3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
Trim41Q5NCC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Trim41Q5NCC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Trim41Q5NCC3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Trim41Q5NCC3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Trim41Q5NCC3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Trim41Q5NCC3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Trim41Q5NCC3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Trim41Q5NCC3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Trim41Q5NCC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
Trim41Q5NCC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Trim41Q5NCC3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Trim41Q5NCC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Trim41Q5NCC3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Trim41Q5NCC3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Trim41Q5NCC3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Trim41Q5NCC3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Trim41Q5NCC3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Trim41Q5NCC3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Trim41Q5NCC3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Trim41Q5NCC3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Trim41Q5NCC3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Trim41Q5NCC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Trim41Q5NCC3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Trim41Q5NCC3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Trim41Q5NCC3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Trim41Q5NCC3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Trim41Q5NCC3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
Trim41Q5NCC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Trim41Q5NCC3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Trim41Q5NCC3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Trim41Q5NCC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Trim41Q5NCC3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
Trim41Q5NCC3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Trim41Q5NCC3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
Trim41Q5NCC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Trim41Q5NCC3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Trim41Q5NCC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Trim41Q5NCC3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Trim41Q5NCC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Trim41Q5NCC3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Trim41Q5NCC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Trim41Q5NCC3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Trim41Q5NCC3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Trim41Q5NCC3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms