Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx49Q4FZF3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx49Q4FZF3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx49Q4FZF3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx49Q4FZF3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx49Q4FZF3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx49Q4FZF3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx49Q4FZF3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx49Q4FZF3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx49Q4FZF3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx49Q4FZF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx49Q4FZF3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ddx49Q4FZF3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx49Q4FZF3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms