Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Carmil2Q3V3V9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Carmil2Q3V3V9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Carmil2Q3V3V9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Carmil2Q3V3V9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Carmil2Q3V3V9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms