Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp48Q3V0C5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp48Q3V0C5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp48Q3V0C5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Usp48Q3V0C5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp48Q3V0C5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms