Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc160Q3UYG1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc160Q3UYG1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc160Q3UYG1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms