Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1d1Q3UV55 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr1d1Q3UV55 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr1d1Q3UV55 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1d1Q3UV55 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nr1d1Q3UV55 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1d1Q3UV55 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1d1Q3UV55 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1d1Q3UV55 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1d1Q3UV55 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1d1Q3UV55 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms