Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc51Q3URS9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc51Q3URS9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc51Q3URS9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc51Q3URS9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc51Q3URS9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc51Q3URS9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc51Q3URS9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc51Q3URS9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc51Q3URS9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc51Q3URS9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc51Q3URS9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc51Q3URS9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc51Q3URS9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc51Q3URS9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc51Q3URS9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc51Q3URS9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc51Q3URS9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc51Q3URS9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc51Q3URS9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms