Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Edc4Q3UJB9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Edc4Q3UJB9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Edc4Q3UJB9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Edc4Q3UJB9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Edc4Q3UJB9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Edc4Q3UJB9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Edc4Q3UJB9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Edc4Q3UJB9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Edc4Q3UJB9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Edc4Q3UJB9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Edc4Q3UJB9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Edc4Q3UJB9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Edc4Q3UJB9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Edc4Q3UJB9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Edc4Q3UJB9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Edc4Q3UJB9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Edc4Q3UJB9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Edc4Q3UJB9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms