Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lmod2Q3UHZ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lmod2Q3UHZ5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Lmod2Q3UHZ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lmod2Q3UHZ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lmod2Q3UHZ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Lmod2Q3UHZ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lmod2Q3UHZ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Lmod2Q3UHZ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lmod2Q3UHZ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lmod2Q3UHZ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lmod2Q3UHZ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lmod2Q3UHZ5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lmod2Q3UHZ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lmod2Q3UHZ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lmod2Q3UHZ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lmod2Q3UHZ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lmod2Q3UHZ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lmod2Q3UHZ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Lmod2Q3UHZ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lmod2Q3UHZ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lmod2Q3UHZ5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lmod2Q3UHZ5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lmod2Q3UHZ5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lmod2Q3UHZ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Lmod2Q3UHZ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Lmod2Q3UHZ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Lmod2Q3UHZ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms