Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph3aQ3UFY4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rsph3aQ3UFY4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph3aQ3UFY4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph3aQ3UFY4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsph3aQ3UFY4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms