Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccbe1Q3MI99 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccbe1Q3MI99 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccbe1Q3MI99 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms