Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Gli2Q0VGT2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Gli2Q0VGT2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Gli2Q0VGT2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Gli2Q0VGT2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gli2Q0VGT2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gli2Q0VGT2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gli2Q0VGT2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Gli2Q0VGT2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Gli2Q0VGT2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gli2Q0VGT2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gli2Q0VGT2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Gli2Q0VGT2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Gli2Q0VGT2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Gli2Q0VGT2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Gli2Q0VGT2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gli2Q0VGT2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Gli2Q0VGT2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gli2Q0VGT2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Gli2Q0VGT2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gli2Q0VGT2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gli2Q0VGT2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gli2Q0VGT2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Gli2Q0VGT2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Gli2Q0VGT2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Gli2Q0VGT2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Gli2Q0VGT2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Gli2Q0VGT2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gli2Q0VGT2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Gli2Q0VGT2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms