Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Atf4Q06507 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atf4Q06507 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf4Q06507 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms