Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hspg2Q05793 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hspg2Q05793 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hspg2Q05793 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hspg2Q05793 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hspg2Q05793 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms