Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RelaQ04207 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RelaQ04207 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RelaQ04207 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RelaQ04207 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RelaQ04207 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RelaQ04207 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RelaQ04207 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RelaQ04207 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RelaQ04207 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RelaQ04207 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RelaQ04207 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RelaQ04207 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RelaQ04207 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RelaQ04207 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RelaQ04207 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RelaQ04207 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RelaQ04207 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RelaQ04207 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RelaQ04207 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RelaQ04207 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms