Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Grin2bQ01097 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Grin2bQ01097 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Grin2bQ01097 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Grin2bQ01097 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Grin2bQ01097 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Grin2bQ01097 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Grin2bQ01097 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Grin2bQ01097 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Grin2bQ01097 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Grin2bQ01097 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
Grin2bQ01097 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC39.26■■■■□ 3.87
Grin2bQ01097 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Grin2bQ01097 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Grin2bQ01097 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Grin2bQ01097 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Grin2bQ01097 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Grin2bQ01097 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Grin2bQ01097 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Grin2bQ01097 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Grin2bQ01097 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Grin2bQ01097 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Grin2bQ01097 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Grin2bQ01097 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Grin2bQ01097 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Grin2bQ01097 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Grin2bQ01097 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Grin2bQ01097 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Grin2bQ01097 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Grin2bQ01097 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Grin2bQ01097 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Grin2bQ01097 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Grin2bQ01097 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Grin2bQ01097 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Grin2bQ01097 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Grin2bQ01097 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Grin2bQ01097 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Grin2bQ01097 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Grin2bQ01097 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Grin2bQ01097 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Grin2bQ01097 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Grin2bQ01097 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Grin2bQ01097 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Grin2bQ01097 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Grin2bQ01097 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Grin2bQ01097 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Grin2bQ01097 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Grin2bQ01097 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Grin2bQ01097 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms