Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rbbp6P97868 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rbbp6P97868 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rbbp6P97868 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rbbp6P97868 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rbbp6P97868 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms