Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba1cP68373 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tuba1cP68373 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tuba1cP68373 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tuba1cP68373 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tuba1cP68373 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms