Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sumo1P63166 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sumo1P63166 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo1P63166 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms