Protein–RNA interactions for Protein: P63054

Pcp4, Calmodulin regulator protein PCP4, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4P63054 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcp4P63054 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcp4P63054 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcp4P63054 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms