Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl23P62830 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl23P62830 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl23P62830 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms