Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem258P61166 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem258P61166 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem258P61166 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem258P61166 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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