Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irf5P56477 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irf5P56477 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Irf5P56477 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Irf5P56477 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Irf5P56477 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irf5P56477 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irf5P56477 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irf5P56477 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irf5P56477 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Irf5P56477 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Irf5P56477 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irf5P56477 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irf5P56477 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf5P56477 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irf5P56477 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irf5P56477 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irf5P56477 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irf5P56477 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Irf5P56477 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Irf5P56477 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Irf5P56477 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irf5P56477 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irf5P56477 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irf5P56477 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irf5P56477 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irf5P56477 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Irf5P56477 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irf5P56477 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irf5P56477 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Irf5P56477 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms