Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Map3k1P53349 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Map3k1P53349 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Map3k1P53349 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Map3k1P53349 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Map3k1P53349 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Map3k1P53349 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Map3k1P53349 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Map3k1P53349 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Map3k1P53349 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Map3k1P53349 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Map3k1P53349 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Map3k1P53349 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Map3k1P53349 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Map3k1P53349 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Map3k1P53349 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Map3k1P53349 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Map3k1P53349 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Map3k1P53349 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Map3k1P53349 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Map3k1P53349 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Map3k1P53349 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Map3k1P53349 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Map3k1P53349 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Map3k1P53349 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Map3k1P53349 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Map3k1P53349 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Map3k1P53349 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Map3k1P53349 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Map3k1P53349 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Map3k1P53349 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Map3k1P53349 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Map3k1P53349 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Map3k1P53349 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Map3k1P53349 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Map3k1P53349 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Map3k1P53349 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Map3k1P53349 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Map3k1P53349 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Map3k1P53349 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Map3k1P53349 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Map3k1P53349 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Map3k1P53349 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Map3k1P53349 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Map3k1P53349 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Map3k1P53349 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Map3k1P53349 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Map3k1P53349 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Map3k1P53349 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Map3k1P53349 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Map3k1P53349 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Map3k1P53349 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Map3k1P53349 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Map3k1P53349 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms