Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa13P50711 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa13P50711 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa13P50711 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa13P50711 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa13P50711 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa13P50711 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa13P50711 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa13P50711 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Defa13P50711 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa13P50711 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa13P50711 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms