Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pbx1P41778 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pbx1P41778 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pbx1P41778 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pbx1P41778 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbx1P41778 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms