Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csf3rP40223 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csf3rP40223 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csf3rP40223 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csf3rP40223 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csf3rP40223 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf3rP40223 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf3rP40223 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csf3rP40223 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf3rP40223 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf3rP40223 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms