Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Folr1P35846 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Folr1P35846 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Folr1P35846 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Folr1P35846 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Folr1P35846 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Folr1P35846 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Folr1P35846 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Folr1P35846 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Folr1P35846 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Folr1P35846 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Folr1P35846 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Folr1P35846 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Folr1P35846 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Folr1P35846 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms