Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ifnar1P33896 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ifnar1P33896 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ifnar1P33896 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ifnar1P33896 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms