Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pola1P33609 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Pola1P33609 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Pola1P33609 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pola1P33609 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pola1P33609 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pola1P33609 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pola1P33609 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pola1P33609 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pola1P33609 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pola1P33609 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pola1P33609 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pola1P33609 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pola1P33609 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Pola1P33609 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pola1P33609 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pola1P33609 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pola1P33609 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pola1P33609 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pola1P33609 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pola1P33609 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pola1P33609 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pola1P33609 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pola1P33609 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pola1P33609 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pola1P33609 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pola1P33609 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pola1P33609 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pola1P33609 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pola1P33609 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pola1P33609 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pola1P33609 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Pola1P33609 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pola1P33609 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pola1P33609 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Pola1P33609 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pola1P33609 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pola1P33609 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Pola1P33609 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pola1P33609 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pola1P33609 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pola1P33609 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pola1P33609 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pola1P33609 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pola1P33609 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pola1P33609 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pola1P33609 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Pola1P33609 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pola1P33609 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Pola1P33609 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pola1P33609 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pola1P33609 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pola1P33609 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pola1P33609 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pola1P33609 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pola1P33609 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pola1P33609 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pola1P33609 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pola1P33609 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pola1P33609 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Pola1P33609 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pola1P33609 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Pola1P33609 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms