Protein–RNA interactions for Protein: P30275

Ckmt1, Creatine kinase U-type, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckmt1P30275 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ckmt1P30275 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckmt1P30275 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckmt1P30275 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckmt1P30275 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckmt1P30275 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms