Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Spi1P17433 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spi1P17433 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spi1P17433 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spi1P17433 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spi1P17433 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spi1P17433 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spi1P17433 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spi1P17433 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spi1P17433 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spi1P17433 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spi1P17433 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms