Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl1P10146 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl1P10146 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl1P10146 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms