Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6gP09174 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde6gP09174 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6gP09174 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde6gP09174 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6gP09174 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6gP09174 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6gP09174 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6gP09174 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6gP09174 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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