Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb1P09055 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb1P09055 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb1P09055 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb1P09055 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb1P09055 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb1P09055 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb1P09055 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb1P09055 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb1P09055 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb1P09055 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb1P09055 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itgb1P09055 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb1P09055 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms