Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt1P04104 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt1P04104 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt1P04104 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt1P04104 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt1P04104 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt1P04104 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt1P04104 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt1P04104 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt1P04104 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt1P04104 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt1P04104 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms